ボスゲームモードでは「あ」で対決可能。
ボスゲームモードでは「い」で対決可能。
ボスゲームモードでは「か」で対決可能。
ボスゲームモードでは「え」で対決可能。
ボスゲームモードでは「う」で対決可能。
ボスゲームモードでは「お」で対決可能。
ボスゲームモードでは「き」で対決可能。
ボスゲームモードでは「く」で対決可能。
| マッシュ | ガンク | バウテン | キューラ |
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| 大きな茸のボスキャラ。前半でルートＡを選ぶと戦うことになる。しりとりを仕掛けてくる。 ボスゲームモードでは「あ」で対決可能。 | 石像の姿をしたボスキャラ。前半でルートＢを選ぶと戦うことになる。しりとりを仕掛けてくる。 ボスゲームモードでは「い」で対決可能。 | 現場作業員の格好をしたおじさんというボスキャラ。他のボスと違い、台詞音が手に持つロックドリルのものになっている。ルートＡで必ず戦うが、ルートＢを途中でルートＡに向かっても戦う。神経衰弱をしかけてくる。 ボスゲームモードでは「か」で対決可能。 | コウモリのボスキャラ。前半のルートＢ限定で、途中ルートＡに合流すると出会えない。しりとりを仕掛けてくる。 ボスゲームモードでは「え」で対決可能。 |
| マジョーラ | アリゲ | クロコ | ゲッハー |
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| 本作唯一の女性ボスキャラ。しりとりを仕掛けてくるが、台詞パターンは女性のものなので彼女専用になっている。 ボスゲームモードでは「う」で対決可能。 | 緑色のワニのボスキャラ。ラスボスを除いて最難関のしりとり使い。前半のルート分岐のどちらでも戦うことになる。強敵。 ボスゲームモードでは「お」で対決可能。 | 桃色のワニのボスキャラ。本作唯一の色違いボス。アリゲとは違い、神経衰弱をしかけてくる。 ボスゲームモードでは「き」で対決可能。 | ハゲワシのボスキャラ。ラスボスを除いて本作最難関の神経衰弱使い。ルート分岐やワープを駆使しても絶対に戦わなくてはならない。 ボスゲームモードでは「く」で対決可能。 |
| ドクターデビル | |
 | 突如島を侵略してきた悪の天才科学者。ワギャンの宿敵。 デビル王国という拠点があるらしい。実は王様なのだろうか。 手下たちを引き連れて島の侵略をする悪党ではあるが、負けを認めれば潔く立ち去ったり、ワギャンに勝つためにゲームの特訓をしたり、コミカルな描写も多い。ただし諦めは結構悪い。 また直接誰かの命を奪うような描写もなかったりする。ワギャンの兄や傷ついた兵士は、どうやって死ぬことになったのだろうか？ 唯一ボスゲームを２連続で行う。しりとりは制限時間が回復しない上に、ノルマのポイントを超えていない状態でデビルが手詰まりになると、仕切り直しになってしまうので、かなり難しい。 裏コースでのリベンジは正史になっているらしく、スーパーワギャンランドでの侵略は３度目らしい。 本作ではボスゲーム中の台詞が全て専用のものになっている。 りんごりらっぱんだちょう。 |